Mus musculus Protein: Rcl1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-156867.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rcl1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA terminal phosphate cyclase-like 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2310040A02Rik; AI789745; C76567; Rnac; RPCL1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000067579 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156865 (Rcl1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Does not have cyclase activity. Plays a role in 40S- ribosomal-subunit biogenesis in the early pre-rRNA processing steps at sites A0, A1 and A2 that are required for proper maturation of the 18S RNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1913275 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000228
RNA 3\'-terminal phosphate cyclase IPR013791 RNA 3\'-terminal phosphate cyclase, insert domain IPR013792 RNA 3\'-terminal phosphate cyclase/enolpyruvate transferase, alpha/beta IPR016443 RNA 3\'-terminal phosphate cyclase type 2 IPR023797 RNA 3\'-terminal phosphate cyclase domain |
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PFAM |
PF05189
PF01137 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF005378
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SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9JJT0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9JJT0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 59028 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.400002 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_067500 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rcl1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS29731 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ276895 AK009709 BC004574 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH04574 BAB26454 CAB89817 | ||||||||||||||||||||||