Mus musculus Protein: Usp39 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-156991.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Usp39 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ubiquitin specific peptidase 39 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA408960; AI894154; CGI-21; D6Wsu157e; SAD1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000064515 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-156989 (Usp39) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a role in pre-mRNA splicing as a component of the U4/U6-U5 tri-snRNP, one of the building blocks of the spliceosome. Regulates AURKB mRNA levels, and thereby plays a role in cytokinesis and in the spindle checkpoint. Does not have ubiquitin-specific peptidase activity, but could be a competitor of ubiquitin C-terminal hydrolases (UCHs) (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 66 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:107622 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001394
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase IPR001607 Zinc finger, UBP-type IPR028889 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-like domain |
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PFAM |
PF00443
PF02148 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00290
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3TIX9 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q3TIX9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 28035 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.474311 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_613058 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Usp39 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20238 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK010443 AK018595 AK033105 AK045062 AK088354 AK165625 AK167668 AK168003 BC026983 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH26983 BAB26944 BAB31299 BAC28153 BAC32203 BAC40299 BAE38302 BAE39717 BAE39991 | ||||||||||||||||||||||