Homo sapiens Protein: RPA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-15787.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | replication protein A1, 70kDa | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HSSB; MST075; REPA1; RF-A; RP-A; RPA70; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000254719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-15783 (RPA1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | As part of the heterotrimeric replication protein A complex (RPA/RP-A), binds and stabilizes single-stranded DNA intermediates, that form during DNA replication or upon DNA stress. It prevents their reannealing and in parallel, recruits and activates different proteins and complexes involved in DNA metabolism. Thereby, it plays an essential role both in DNA replication and the cellular response to DNA damage (PubMed:9430682). In the cellular response to DNA damage, the RPA complex controls DNA repair and DNA damage checkpoint activation. It is required for the recruitment of the DNA double-strand break repair factors RAD51 and RAD52 to chromatin in response to DNA damage (PubMed:17765923). Also recruits to sites of DNA damage proteins like XPA and XPG that are involved in nucleotide excision repair and is required for this mechanism of DNA repair (PubMed:7697716). Plays also a role in base excision repair (BER) probably through interaction with UNG (PubMed:9765279). Through RFWD3 may activate CHEK1 and play a role in replication checkpoint control. Also recruits SMARCAL1/HARP, which is involved in replication fork restart, to sites of DNA damage. May also play a role in telomere maintenance (PubMed:17959650). As part of the alternative replication protein A complex, aRPA, binds single- stranded DNA and probably plays a role in DNA repair. Compared to the RPA2-containing, canonical RPA complex, may not support chromosomal DNA replication and cell cycle progression through S- phase. The aRPA may not promote efficient priming by DNA polymerase alpha but could support DNA polymerase delta synthesis in the presence of PCNA and replication factor C (RFC), the dual incision/excision reaction of nucleotide excision repair and RAD51-dependent strand exchange (PubMed:19996105). {ECO:0000269PubMed:12791985, ECO:0000269PubMed:17765923, ECO:0000269PubMed:17959650, ECO:0000269PubMed:19116208, ECO:0000269PubMed:19996105, ECO:0000269PubMed:7697716, ECO:0000269PubMed:7700386, ECO:0000269PubMed:9430682, ECO:0000269PubMed:9765279}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:17959650}. Nucleus, PML body {ECO:0000269PubMed:17959650}. Note=Enriched in PML bodies in cells displaying alternative lengthening of their telomeres. {ECO:0000269PubMed:17959650}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 495 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004365
OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type IPR004591 Replication factor A protein 1 IPR007199 Replication factor-A protein 1, N-terminal IPR012340 Nucleic acid-binding, OB-fold IPR013955 Replication factor A, C-terminal |
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PFAM |
PF01336
PF04057 PF08646 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P27694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P27694 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | I3L524 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6117 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.595562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10289 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 179835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209732 AC130689 AK289704 AY599563 BC018126 CH471108 M63488 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36584 AAH18126 AAS94324 BAD92969 BAF82393 EAW90574 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||