Mus musculus Protein: Ntrk2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-158488.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Ntrk2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | GP145-TrkB/GP95-TrkB; Tkrb; trk-B; trkB; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000078757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-158484 (Ntrk2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor tyrosine kinase involved in the development and the maturation of the central and the peripheral nervous systems through regulation of neuron survival, proliferation, migration, differentiation, and synapse formation and plasticity. Receptor for BDNF/brain-derived neurotrophic factor and NTF4/neurotrophin- 4. Alternatively can also bind NTF3/neurotrophin-3 which is less efficient in activating the receptor but regulates neuron survival through NTRK2. Upon ligand-binding, undergoes homodimerization, autophosphorylation and activation. Recruits, phosphorylates and/or activates several downstream effectors including SHC1, FRS2, SH2B1, SH2B2 and PLCG1 that regulate distinct overlapping signaling cascades. Through SHC1, FRS2, SH2B1, SH2B2 activates the GRB2-Ras-MAPK cascade that regulates for instance neuronal differentiation including neurite outgrowth. Through the same effectors controls the Ras-PI3 kinase-AKT1 signaling cascade that mainly regulates growth and survival. Through PLCG1 and the downstream protein kinase C-regulated pathways controls synaptic plasticity. Thereby, plays a role in learning and memory by regulating both short term synaptic function and long-term potentiation. PLCG1 also leads to NF-Kappa-B activation and the transcription of genes involved in cell survival. Hence, it is able to suppress anoikis, the apoptosis resulting from loss of cell-matrix interactions. Isoform GP95-TRKB may also play a role in neutrophin-dependent calcium signaling in glial cells and mediate communication between neurons and glia. {ECO:0000269PubMed:10571233, ECO:0000269PubMed:12367511, ECO:0000269PubMed:15329723, ECO:0000269PubMed:15372074, ECO:0000269PubMed:1645620, ECO:0000269PubMed:16801538, ECO:0000269PubMed:21414899, ECO:0000269PubMed:8402890, ECO:0000269PubMed:9728914}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:14581459}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:14581459}. Endosome membrane {ECO:0000269PubMed:14581459}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:14581459}. Note=Internalized to endosomes upon ligand-binding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed in the central and peripheral nervous system. The different forms are differentially expressed in various cell types. Isoform GP95-TRKB is specifically expressed in glial cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 21 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 22 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:97384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000372
Leucine-rich repeat-containing N-terminal IPR000483 Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR000719 Protein kinase domain IPR001245 Serine-threonine/tyrosine-protein kinase catalytic domain IPR002290 Serine/threonine- /dual specificity protein kinase, catalytic domain IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR011009 Protein kinase-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR020455 Tyrosine-protein kinase, neurotrophic receptor, type 2 IPR020635 Tyrosine-protein kinase, catalytic domain IPR020777 Tyrosine-protein kinase, neurotrophic receptor |
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PFAM |
PF01462
PF01463 PF00069 PF07714 PF07679 |
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PRINTS |
PR00109
PR01941 PR01939 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00013
SM00082 SM00220 SM00408 SM00409 SM00219 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P15209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P15209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | W8R8Q6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.471896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001269890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Ntrk2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS26573 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK018789 AK147391 AK160789 BC052014 KC855567 KF982303 M33385 X17647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA40482 AAH52014 AGR50958 AHL58822 BAB31412 BAE27880 BAE36012 CAA35636 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||