Homo sapiens Protein: NANOG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-16536.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NANOG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Nanog homeobox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000229307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-16534 (NANOG) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcription regulator involved in inner cell mass and embryonic stem (ES) cells proliferation and self-renewal. Imposes pluripotency on ES cells and prevents their differentiation towards extraembryonic endoderm and trophectoderm lineages. Blocks bone morphogenetic protein-induced mesoderm differentiation of ES cells by physically interacting with SMAD1 and interfering with the recruitment of coactivators to the active SMAD transcriptional complexes. Acts as a transcriptional activator or repressor. Binds optimally to the DNA consensus sequence 5'-TAAT[GT][GT]-3' or 5'- [CG][GA][CG]C[GC]ATTAN[GC]-3'. Able to autorepress its expression in differentiating (ES) cells: binds to its own promoter following interaction with ZNF281/ZFP281, leading to recruitment of the NuRD complex and subsequent repression of expression. When overexpressed, promotes cells to enter into S phase and proliferation. {ECO:0000269PubMed:15983365, ECO:0000269PubMed:16000880, ECO:0000269PubMed:16391521}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00108, ECO:0000269PubMed:15983365}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in testicular carcinoma and derived germ cell tumors (at protein level). Expressed in fetal gonads, ovary and testis. Also expressed in ovary teratocarcinoma cell line and testicular embryonic carcinoma. Not expressed in many somatic organs and oocytes. {ECO:0000269PubMed:12787504, ECO:0000269PubMed:12787505, ECO:0000269PubMed:14990856, ECO:0000269PubMed:15982323, ECO:0000269PubMed:16391521}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 156 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR009057 Homeodomain-like |
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PFAM |
PF00046
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H9S0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9H9S0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | J7H4F6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 79923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.635882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_079141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20857 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 607937 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB093576 AC006517 AK022643 AY230262 AY578089 CH471116 JX104943 JX104944 JX104945 JX104946 JX104947 JX104949 JX104951 JX104952 JX104953 JX104954 JX104955 JX104956 JX104957 JX104958 JX104959 JX104960 JX104961 JX104962 JX104963 JX104964 JX104965 JX104966 JX104967 JX104968 JX104969 JX104970 JX104971 JX104972 JX104973 JX104974 JX104975 JX104976 JX104978 JX104979 JX104980 JX104981 JX104982 JX104983 JX104984 JX104985 JX104986 JX104987 JX104988 JX104989 JX104990 JX104991 JX104992 JX104993 JX104994 JX104995 JX104996 JX104997 JX104998 JX104999 JX105000 JX105001 JX105002 JX105003 JX105004 JX105005 JX105006 JX105007 JX105008 JX105009 JX105010 JX105011 JX105012 JX105013 JX105014 JX105015 JX105016 JX105017 JX105018 JX105019 JX105020 JX105021 JX105022 JX105023 JX105024 JX105025 JX105026 JX105027 JX105029 JX105030 JX105031 JX105032 JX105033 JX105034 JX105035 JX105036 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAP49529 AAT81526 AFP90963 AFP90964 AFP90965 AFP90966 AFP90967 AFP90969 AFP90971 AFP90972 AFP90973 AFP90974 AFP90975 AFP90976 AFP90977 AFP90978 AFP90979 AFP90980 AFP90981 AFP90982 AFP90983 AFP90984 AFP90985 AFP90986 AFP90987 AFP90988 AFP90989 AFP90990 AFP90991 AFP90992 AFP90993 AFP90994 AFP90995 AFP90996 AFP90998 AFP90999 AFP91000 AFP91001 AFP91002 AFP91003 AFP91004 AFP91005 AFP91006 AFP91007 AFP91008 AFP91009 AFP91010 AFP91011 AFP91012 AFP91013 AFP91014 AFP91015 AFP91016 AFP91017 AFP91018 AFP91019 AFP91020 AFP91021 AFP91022 AFP91023 AFP91024 AFP91025 AFP91026 AFP91027 AFP91028 AFP91029 AFP91030 AFP91031 AFP91032 AFP91033 AFP91034 AFP91035 AFP91036 AFP91037 AFP91038 AFP91039 AFP91040 AFP91041 AFP91042 AFP91043 AFP91044 AFP91045 AFP91046 AFP91047 AFP91049 AFP91050 AFP91051 AFP91052 AFP91053 AFP91054 AFP91055 AFP91056 BAB14151 BAC76999 EAW88649 EAW88651 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||