Version 5.4
| Mus musculus Protein: Nhp2l1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-165984.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Nhp2l1 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | NHP2 non-histone chromosome protein 2-like 1 (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000091840 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-165982 (Nhp2l1) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Binds to the 5'-stem-loop of U4 snRNA and may play a role in the late stage of spliceosome assembly. The protein undergoes a conformational change upon RNA-binding (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 47 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:893586 | ||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000948
Ribosomal protein L7Ae, prokaryotes IPR002415 H/ACA ribonucleoprotein complex, subunit Nhp2, eukaryote IPR004038 Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 IPR013241 RNase P, subunit Pop3 IPR018492 Ribosomal protein L7Ae/L8/Nhp2 family IPR029064 50S ribosomal protein L30e-like |
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| PFAM |
PF01248
PF08228 |
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| PRINTS |
PR00884
PR00883 PR00881 |
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| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART | |||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9D0T1 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q9D0T1 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 20826 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.464206 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_035612 | ||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Nhp2l1 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS37154 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AK004489 AK134943 AK145608 AK168930 AK169103 BC026755 BC054450 BC083315 U95114 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAC53177 AAH26755 AAH54450 AAH83315 BAB23329 BAE22349 BAE26537 BAE40743 BAE40885 | ||||||||||||||||||