Mus musculus Protein: Rab13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-166107.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rab13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RAB13, member RAS oncogene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 0610007N03Rik; B230212B15Rik; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000070588 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166105 (Rab13) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | The small GTPases Rab are key regulators of intracellular membrane trafficking, from the formation of transport vesicles to their fusion with membranes. Rabs cycle between an inactive GDP-bound form and an active GTP-bound form that is able to recruit to membranes different sets of downstream effectors directly responsible for vesicle formation, movement, tethering and fusion. That Rab is involved in endocytic recycling and regulates the transport to the plasma membrane of transmembrane proteins like the tight junction protein OCLN/occludin. Thereby, it regulates the assembly and the activity of tight junctions. Moreover, it may also regulate tight junction assembly by activating the PKA signaling pathway and by reorganizing the actin cytoskeleton through the activation of the downstream effectors PRKACA and MICALL2 respectively. Through its role in tight junction assembly, may play a role in the establishment of Sertoli cell barrier. Plays also a role in angiogenesis through regulation of endothelial cells chemotaxis. Also involved in neurite outgrowth. Has also been proposed to play a role in post-Golgi membrane trafficking from the TGN to the recycling endosome. Finally, it has been involved in insulin- induced transport to the plasma membrane of the glucose transporter GLUT4 and therefore may play a role in glucose homeostasis. {ECO:0000269PubMed:21543326}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Lipid-anchor {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle membrane {ECO:0000250}; Lipid-anchor {ECO:0000250}; Cytoplasmic side {ECO:0000250}. Cell junction, tight junction {ECO:0000250}. Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane {ECO:0000250}. Recycling endosome membrane {ECO:0000250}. Cell projection, lamellipodium {ECO:0000269PubMed:21543326}. Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle membrane {ECO:0000250}. Note=Tight junctions or associated with vesicles scattered throughout the cytoplasm in cells lacking tight junctions (By similarity). Relocalizes to the leading edge of lamellipodia in migrating endothelial cells. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1927232 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000795
Elongation factor, GTP-binding domain IPR001806 Small GTPase superfamily IPR002041 Ran GTPase IPR003578 Small GTPase superfamily, Rho type IPR003579 Small GTPase superfamily, Rab type IPR005225 Small GTP-binding protein domain IPR006689 Small GTPase superfamily, ARF/SAR type IPR006762 Gtr1/RagA G protein IPR013684 Mitochondrial Rho-like IPR019009 Signal recognition particle receptor, beta subunit IPR020849 Small GTPase superfamily, Ras type IPR024156 Small GTPase superfamily, ARF type IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00009
PF00071 PF00025 PF04670 PF08477 PF09439 |
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PRINTS |
PR00315
PR00449 PR00627 PR00328 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00176
SM00174 SM00175 SM00173 SM00177 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9DD03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9DD03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YUS4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 68328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.29355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080953 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rab13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17522 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC119825 AK002303 BC027214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH27214 BAB22000 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||