Mus musculus Protein: Strbp | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-166158.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Strbp | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | spermatid perinuclear RNA binding protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 6430510M02Rik; AI852513; C230082I21Rik; C86322; Spnr; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000072047 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-166154 (Strbp) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in spermatogenesis and sperm function. Plays a role in regulation of cell growth (By similarity). Binds to double-stranded DNA and RNA (By similarity). Binds most efficiently to poly(I:C) RNA than to poly(dI:dC) DNA (By similarity). Binds also to single-stranded poly(G) RNA (By similarity). Binds non-specifically to the mRNA PRM1 3'-UTR and adenovirus VA RNA. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:11336498, ECO:0000269PubMed:7744952}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 2: Cytoplasm, cytoskeleton. Note=Microtubule-associated that localizes to the manchette in developing spermatids. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Isoform 2 is expressed in spermatocytes (at protein level). Expressed in testis, thymus, ovary, liver, kidney, heart, spleen and brain. Expressed in cortex, dentate gyrus and Purkinje cell layer and granule cells of the cerebellum. {ECO:0000269PubMed:11336498, ECO:0000269PubMed:7744952}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:104626 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR006561
DZF IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain |
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PFAM |
PF07528
PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00572
SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q91WM1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q91WM1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9CVW0 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20744 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.477856 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | XP_006497880 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Strbp | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38118 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK006314 AL805959 AL953890 BC014710 BX545905 X84692 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH14710 BAB24521 CAA59167 | ||||||||||||||||||||||