Version 5.4
| Mus musculus Protein: Cntn6 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-173672.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Cntn6 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | contactin 6 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | NB-3; | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000086623 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-173670 (Cntn6) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Contactins mediate cell surface interactions during nervous system development. Participates in oligodendrocytes generation by acting as a ligand of NOTCH1. Its association with NOTCH1 promotes NOTCH1 activation through the released notch intracellular domain (NICD) and subsequent translocation to the nucleus (By similarity). Involved in motor coordination. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:12884264}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Lipid-anchor, GPI-anchor {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Expressed in brain. In brain, it is preferentially expressed in the accessory olfactory bulb, layers II/III and V of the cerebral cortex, piriform cortex, anterior thalamic nuclei, locus coeruleus of the pons and mesencephalic trigeminal nucleus and in Purkinje cells of the cerebellum. {ECO:0000269PubMed:10717476}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:1858223 | ||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003598
Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR003961 Fibronectin, type III IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin |
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| PFAM |
PF00041
PF01108 PF07679 PF07686 PF00047 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00408
SM00409 SM00060 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q9JMB8 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | E0CY26 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 53870 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.321671 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_059079 | ||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Cntn6 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS20394 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB032602 AC116110 AC117728 AC153023 AC153990 AK052972 BC076594 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH76594 BAA92367 BAC35227 | ||||||||||||||||||