Mus musculus Protein: Capn6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-176943.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Capn6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | calpain 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000084573 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-176941 (Capn6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Microtubule-stabilizing protein that may be involved in the regulation of microtubule dynamics and cytoskeletal organization. May act as a regulator of RAC1 activity through interaction with ARHGEF2 to control lamellipodial formation and cell mobility. Does not seem to have protease activity as it has lost the active site residues. {ECO:0000269PubMed:17210638, ECO:0000269PubMed:21406564}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, perinuclear region {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton, spindle {ECO:0000269PubMed:17210638, ECO:0000269PubMed:20814968}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1100850 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000008
C2 domain IPR001300 Peptidase C2, calpain, catalytic domain IPR022682 Peptidase C2, calpain, large subunit, domain III IPR022683 Peptidase C2, calpain, domain III IPR022684 Peptidase C2, calpain family |
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PFAM |
PF00168
PF00648 PF01067 |
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PRINTS |
PR00360
PR00704 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00239
SM00230 SM00720 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O35646 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O35646 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12338 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.30290 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_031629 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Capn6 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS30455 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK145116 BX530055 Y12582 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | BAE26243 CAA73161 CAM25088 | ||||||||||||||||||||||