Mus musculus Protein: Efhd1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-178083.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Efhd1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | EF hand domain containing 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 4931430I01Rik; AI452351; mitocalcin; PP3051; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000027472 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-178079 (Efhd1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | |||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highest expression in testis, followed by ovary, kidney, cerebrum, cerebellum, heart, liver, and spleen. In the cerebrum and cerebellum, undetectable at embryonic stages, expression increases after birth up to adult stage. In adult CNS, detected in neurons of the cerebellum, cerebrum and hippocampus formation, including dentate gyrus and Cornu Ammonis, but not in the white matter. In the testis, expressed in spermatocytes, but not in spermatogonia nor in interstitial cells. In ovary, found predominantly in mural granulosa cells and those of the cumulus oophorus. In kidney, expressed in collecting ducts, but not in glomeruli. Not detected in skeletal muscle. {ECO:0000269PubMed:12270117}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1921607 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002048
EF-hand domain |
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PFAM |
PF00036
PF13202 PF13405 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00054
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9D4J1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9D4J1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 98363 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.399025 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_083165 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Efhd1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS15132 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AK016491 AK045911 AK144175 AK171846 BC019531 BC085088 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH19531 AAH85088 BAB30268 BAC32529 BAE25747 BAE42694 | ||||||||||||||||||||||