Mus musculus Protein: Rpgrip1l | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-179796.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Rpgrip1l | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Rpgrip1-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000042702 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-179794 (Rpgrip1l) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Negatively regulates signaling through the G-protein coupled thromboxane A2 receptor (TBXA2R) (By similarity). May be involved in mechanisms like programmed cell death, craniofacial development, patterning of the limbs, and formation of the left- right axis. Involved in the organization of apical junctions in kidney cells together with NPHP1 and NPHP4. Does not seem to be strictly required for ciliogenesis. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:10501967, ECO:0000269PubMed:11956760, ECO:0000269PubMed:21565611}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Cytoplasm, cytoskeleton, cilium basal body. Cytoplasm, cytoskeleton, cilium axoneme. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome {ECO:0000250}. Cell junction, tight junction {ECO:0000250}. Note=In cultured renal cells, it localizes diffusely in the cytoplasm but, as cells approach confluence, it accumulates to basolateral tight junctions. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. Not found in heart and skin. {ECO:0000269PubMed:10501967}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 47 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1920563 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000008
C2 domain IPR010980 Cytochrome c/b562 IPR021656 Protein of unknown function DUF3250 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00168
PF11618 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00360
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00239
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8CG73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8CG73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RIK9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 244585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.418185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_775607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Rpgrip1l | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC139351 AJ344253 CH466525 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | CAC87257 EDL11076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||