Mus musculus Protein: Slitrk1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-185902.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Slitrk1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | SLIT and NTRK-like family, member 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 3200001I04Rik; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000097897 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-185900 (Slitrk1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Enhances neuronal dendrite outgrowth. {ECO:0000269PubMed:14550773}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | In the adult, significant expression is detected only in the brain. Broadly expressed in embryonic brain with highest expression in subventricular zone, subplate, cortical plate, pyramidal cell layer of hippocampus, thalamus and hypothalamus where levels are highest in ventromedial hypothalamus and medial part of periaqueductal gray matter. Also expressed in mantle layer of spinal cord and in lateral and medial motor columns. {ECO:0000269PubMed:14550773}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2679446 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype |
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PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00369 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q810C1 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q810C1 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q69Z70 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 76965 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.403696 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_951020 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Slitrk1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS27325 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB097570 AK014285 AK173296 BC157902 CH466544 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI57903 BAB29244 BAC67204 BAD32574 EDL00537 | ||||||||||||||||||||||