Mus musculus Protein: Amigo1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-186433.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Amigo1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | adhesion molecule with Ig like domain 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000061244 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-186431 (Amigo1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Promotes growth and fasciculation of neurites from cultured hippocampal neurons. May be involved in fasciculation as well as myelination of developing neural axons. May have a role in regeneration as well as neural plasticity in the adult nervous system. May mediate homophilic as well as heterophilic cell-cell interaction and contribute to signal transduction through its intracellular domain (By similarity). {ECO:0000250UniProtKB:Q80ZD7}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000269PubMed:21983541}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000269PubMed:21983541}. Note=Associated with axons of neuronal cells. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | High levels in cerebellum, cerebrum, and retina. Low levels in liver, kidney, small intestine, spleen, lung and heart. {ECO:0000269PubMed:12629050}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2653612 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set |
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PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 PF07679 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00369 SM00408 SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q80ZD8 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q80ZD8 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 229715 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.487838 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_666249 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | 2XOT | ||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Amigo1 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS17753 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB167509 AK035960 AK173118 AL671854 AY237008 BC010598 BC022907 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH10598 AAH22907 AAO48949 BAC29259 BAD12541 BAD32396 CAM27260 | ||||||||||||||||||||||