Mus musculus Protein: Usp5 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-188028.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Usp5 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | ubiquitin specific peptidase 5 (isopeptidase T) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AA407472; ISOT; ISOT-1; Ucht; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000041299 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-188026 (Usp5) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Cleaves linear and branched multiubiquitin polymers with a marked preference for branched polymers. Involved in unanchored 'Lys-48'-linked polyubiquitin disassembly. Binds linear and 'Lys- 63'-linked polyubiquitin with a lower affinity (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | |||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 43 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1347343 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000449
Ubiquitin-associated domain/translation elongation factor EF-Ts, N-terminal IPR001394 Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase IPR001607 Zinc finger, UBP-type IPR009060 UBA-like IPR015940 Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote IPR016652 Ubiquitinyl hydrolase IPR028889 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-like domain |
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PFAM |
PF00627
PF00443 PF02148 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF016308
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SMART |
SM00290
SM00165 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P56399 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P56399 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D3YYA5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 22225 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3571 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_038728 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Usp5 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS20531 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC002397 AC142254 BC066993 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC36015 AAH66993 | ||||||||||||||||||||||