Mus musculus Protein: Usp49 | |||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-189402.6 | ||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||
Gene Symbol | Usp49 | ||||||||||||||||
Protein Name | ubiquitin specific peptidase 49 | ||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000024779 | ||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-488556 (Usp49) | ||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||
Function | Specifically deubiquitinates histone H2B at 'Lys-120' (H2BK120Ub). H2BK120Ub is a specific tag for epigenetic transcriptional activation and acts as a regulator of mRNA splicing. Deubiquitination is required for efficient cotranscriptional splicing of a large set of exons (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 34 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2685391 | ||||||||||||||||
InterPro |
IPR001394
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase IPR001607 Zinc finger, UBP-type IPR028889 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase-like domain |
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PFAM |
PF00443
PF02148 |
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PRINTS | |||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||
SMART |
SM00290
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||
SwissProt | Q6P9L4 | ||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q6P9L4 | ||||||||||||||||
TrEMBL | D3YZI5 | ||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||
Entrez Gene | 224836 | ||||||||||||||||
UniGene | Mm.59393 | ||||||||||||||||
RefSeq | NP_940813 | ||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||
MGI Symbol | Usp49 | ||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||
CCDS | CCDS28852 | ||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||
EMBL | AC139214 BC060712 GL456179 | ||||||||||||||||
GenPept | AAH60712 | ||||||||||||||||