Version 5.4
| Mus musculus Protein: Clec10a | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-193588.7 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Clec10a | ||||||||||||||||||
| Protein Name | C-type lectin domain family 10, member A | ||||||||||||||||||
| Synonyms | CD301a; M-ASGP-BP-1; Mgl; Mgl1; | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000099631 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-193586 (Clec10a) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Recognizes terminal galactose and N-acetylgalactosamine units. May participate in the interaction between tumoricidal macrophages and tumor cells. Plays a role in the recruitment of inflammatory monocytes to adipose tissue in diet-induced obesity. {ECO:0000269PubMed:19995956}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Membrane; Single-pass type II membrane protein. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Detected in lymph node in the subcapsular sinus, interfollicular regions, T and B-cell boundary and in the areas surrounding high endothelial venules (at protein level). Expressed on the surface of activated macrophages. Expressed in heart, lung, testis, skeletal muscle, spleen, brain, kidney and thymus. Expressed in P388, RAW 264.7 and M1 cell lines. {ECO:0000269PubMed:12016228, ECO:0000269PubMed:15364954}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:96975 | ||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR001304
C-type lectin IPR002353 Type-2 ice-structuring protein IPR005640 Hepatic lectin, N-terminal IPR009053 Prefoldin IPR016187 C-type lectin fold |
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| PFAM |
PF00059
PF03954 |
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| PRINTS |
PR00356
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| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00034
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | P49300 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-P49300 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | A2CF63 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 17312 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.486966 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_034926 | ||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Clec10a | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS24936 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AF132744 AL669869 BC014811 CH466596 CR933731 S36676 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAB22171 AAD31028 AAH14811 CAI35217 CAM28085 EDL12536 | ||||||||||||||||||