Mus musculus Protein: Nlrc4 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-197892.7 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Nlrc4 | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | NLR family, CARD domain containing 4 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000059637 | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-197890 (Nlrc4) | ||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Function | Key component of inflammasomes that indirectly senses specific proteins from pathogenic bacteria and fungi and responds by assembling an inflammasome complex that promotes caspase-1 activation, cytokine production and macrophage pyroptosis. The NLRC4 inflammasome is activated as part of the innate immune response to a range of intracellular bacteria. It senses pathogenic proteins of the type III secretion system (T3SS) and type IV secretion system (T4SS) such as flagellin and PrgJ-like rod proteins via the Naip proteins (Naip1, Naip2 or Naip5): specific Naip proteins recognize and bind pathogenic proteins, driving assembly and activation of the NLRC4 inflammasome. The NLRC4 inflammasome senses Gram-negative bacteria such as L.pneumophila and P.aeruginosa, enteric pathogens S.typhimurium (Salmonella) and S.flexneri and fungal pathogen C.albicans. In intestine, the NLRC4 inflammasome is able to discriminate between commensal and pathogenic bacteria and specifically drives production of interleukin-1 beta (IL1B) in response to infection by Salmonella or P.aeruginosa. In case of L.pneumophila infection the inflammasome acts by activating caspase-7. {ECO:0000269PubMed:15190255, ECO:0000269PubMed:16648852, ECO:0000269PubMed:16648853, ECO:0000269PubMed:18070936, ECO:0000269PubMed:19343209, ECO:0000269PubMed:20133635, ECO:0000269PubMed:20603313, ECO:0000269PubMed:21874021, ECO:0000269PubMed:21918512, ECO:0000269PubMed:22174673, ECO:0000269PubMed:22231517, ECO:0000269PubMed:22484733, ECO:0000269PubMed:22547706, ECO:0000269PubMed:22885697}. | ||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytosol {ECO:0000269PubMed:22885697}. | ||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed by intestinal mononuclear phagocytes. {ECO:0000269PubMed:22484733}. | ||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:3036243 | ||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001315
CARD domain IPR007111 NACHT nucleoside triphosphatase IPR011029 Death-like domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00619
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00114
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q3UP24 | ||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q3UP24 | ||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 268973 | ||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.311884 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001028539 | ||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 4KXF | ||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Nlrc4 | ||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37692 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK143864 AK171624 CT033749 | ||||||||||||||||||||||||||
GenPept | BAE25573 BAE42570 | ||||||||||||||||||||||||||