Mus musculus Protein: Prpf8 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-200021.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Prpf8 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | pre-mRNA processing factor 8 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000099568 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-200019 (Prpf8) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Functions as a scaffold that mediates the ordered assembly of spliceosomal proteins and snRNAs. Required for the assembly of the U4/U6-U5 tri-snRNP complex. Functions as scaffold that positions spliceosomal U2, U5 and U6 snRNAs at splice sites on pre-mRNA substrates, so that splicing can occur. Interacts with both the 5' and the 3' splice site (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000269PubMed:15169873}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Strongly expressed in testis (preferentially in the outer cell layer), and moderately in ovary (preferentially in granulosa cells). {ECO:0000269PubMed:11275560}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 61 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 89 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:2179381 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000555
JAB1/MPN/MOV34 metalloenzyme domain IPR008972 Cupredoxin IPR009072 Histone-fold IPR012591 PRO8NT domain IPR012592 PROCN domain IPR012984 PROCT domain IPR019580 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U6-snRNA-binding IPR019581 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, U5-snRNA-binding IPR019582 RNA recognition motif, spliceosomal PrP8 IPR021983 PRP8 domain IV core |
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PFAM |
PF01398
PF08082 PF08083 PF08084 PF10596 PF10597 PF10598 PF12134 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00232
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q99PV0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q99PV0 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 192159 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.3757 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Prpf8 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS25048 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB047391 AK041017 AL591496 BC034648 BC054103 BC093481 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH34648 AAH54103 AAH93481 BAB32671 BAC30783 CAI35387 | ||||||||||||||||||||||