Mus musculus Protein: Padi4 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-201306.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Padi4 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | peptidyl arginine deiminase, type IV | ||||||||||||||||||||
Synonyms | Pad4; Pdi4; | ||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000026381 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-201304 (Padi4) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | Catalyzes the citrullination/deimination of arginine residues of proteins such as histones, thereby playing a key role in histone code and regulation of stem cell maintenance. Citrullinates histone H1 at 'Arg-54' (to form H1R54ci), histone H3 at 'Arg-2', 'Arg-8', 'Arg-17' and/or 'Arg-26' (to form H3R2ci, H3R8ci, H3R17ci, H3R26ci, respectively) and histone H4 at 'Arg-3' (to form H4R3ci). Acts as a key regulator of stem cell maintenance by mediating citrullination of histone H1: citrullination of 'Arg- 54' of histone H1 (H1R54ci) results in H1 displacement from chromatin and global chromatin decondensation, thereby promoting pluripotency and stem cell maintenance. Promotes profound chromatin decondensation during the innate immune response to infection in neutrophils by mediating formation of H1R54ci. Citrullination of histone H3 prevents their methylation by CARM1 and HRMT1L2/PRMT1 and represses transcription. Citrullinates EP300/P300 at 'Arg-2142', which favors its interaction with NCOA2/GRIP1. {ECO:0000269PubMed:15339660, ECO:0000269PubMed:20733033, ECO:0000269PubMed:23650392, ECO:0000269PubMed:24463520}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in pluripotent embryonic stem and induced pluripotent stem cells but not multipotent neural stem cells. {ECO:0000269PubMed:24463520}. | ||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1338898 | ||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR008972
Cupredoxin IPR013530 Protein-arginine deiminase, C-terminal IPR013732 Protein-arginine deiminase (PAD) N-terminal IPR013733 Protein-arginine deiminase (PAD), central domain IPR016296 Protein-arginine deiminase, subgroup |
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PFAM |
PF03068
PF08526 PF08527 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF001247
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SMART | |||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Z183 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9Z183 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 18602 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.250358 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_035191 | ||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Padi4 | ||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS18854 | ||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AB013850 AB121692 AL807805 | ||||||||||||||||||||
GenPept | BAA34246 BAD16627 CAM25732 | ||||||||||||||||||||