Homo sapiens Protein: SAFB | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-20252.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SAFB | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | scaffold attachment factor B | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | HAP; HET; SAF-B1; SAFB1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000292123 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-20250 (SAFB) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Binds to scaffold/matrix attachment region (S/MAR) DNA and forms a molecular assembly point to allow the formation of a 'transcriptosomal' complex (consisting of SR proteins and RNA polymerase II) coupling transcription and RNA processing (By similarity). Can function as an estrogen receptor corepressor and can also bind to the HSP27 promoter and decrease its transcription. When associated with RBMX, binds to and stimulates transcription from the SREBF1 promoter (By similarity). Can inhibit cell proliferation. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:19674106}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. Expressed at high levels in the CNS and at low levels in the liver. Expressed in a wide number of breast cancer cell lines. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 76 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR003034 SAP domain |
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PFAM |
PF00076
PF02037 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
SM00513 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q15424 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q15424 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q68DW3 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6294 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.728802 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002958 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10520 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602895 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12142 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04205 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB208780 AC004611 AC011499 AC134303 AK298707 BC126219 BC143937 BC143939 CR749251 L43631 U72355 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC00056 AAC14667 AAC18697 AAI26220 AAI43938 AAI43940 BAD92017 BAH12852 CAH18107 | ||||||||||||||||||||||