Version 5.4
| Mus musculus Protein: Nol9 | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-206258.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Nol9 | ||||||||||||||||||||||
| Protein Name | nucleolar protein 9 | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | 4632412I24Rik; 6030462G04Rik; AI449622; AW490720; | ||||||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000099486 | ||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-206256 (Nol9) | ||||||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
| Function | Polynucleotide 5'-kinase involved in rRNA processing. The kinase activity is required for the processing of the 32S precursor into 5.8S and 28S rRNAs, more specifically for the generation of the major 5.8S(S) form. In vitro, has both DNA and RNA 5'-kinase activities. Probably binds RNA (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus, nucleolus {ECO:0000250UniProtKB:Q5SY16}. Nucleus {ECO:0000269PubMed:22872859}. Note=Colocalizes with pre-60S rRNP particles. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:1921285 | ||||||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR010655
Pre-mRNA cleavage complex II Clp1 IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase IPR029007 MobB-type P-loop domain |
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| PFAM |
PF06807
PF03205 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||||||
| SMART | |||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | Q3TZX8 | ||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q3TZX8 | ||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 74035 | ||||||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.275803 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_083003 | ||||||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Nol9 | ||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS18986 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | AK014568 AK042581 AK046761 AK050948 AK157398 AL611927 BC024877 BC125432 BC132099 CH466594 | ||||||||||||||||||||||
| GenPept | AAH24877 AAI25433 AAI32100 BAB29433 BAC31300 BAC32857 BAC34472 BAE34079 CAM24579 CAM24580 EDL14922 | ||||||||||||||||||||||