Mus musculus Protein: Cdx2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-209015.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Cdx2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | caudal type homeobox 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Cdx-2; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000031650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-209013 (Cdx2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the transcriptional regulation of multiple genes expressed in the intestinal epithelium. Important in broad range of functions from early differentiation to maintenance of the intestinal epithelial lining of both the small and large intestine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Intestine; expressed specifically in gut epithelium where it is not restricted to a particular cell lineage. Abundant expression is seen in the proximal colon with slightly lower levels in distal colon. Expression in the proximal colon is not restricted either to a particular cell lineage or stage of differentiation while in the distal colon it is more abundant in the differentiated cells towards the top of the crypt. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 14 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:88361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000047
Helix-turn-helix motif IPR001356 Homeobox domain IPR006820 Caudal-like activation domain IPR009057 Homeodomain-like IPR020479 Homeodomain, metazoa |
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PFAM |
PF00046
PF04731 |
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PRINTS |
PR00031
PR00024 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P43241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P43241 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q543L9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 12591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.20358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_031699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Cdx2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS19878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK049566 BC103516 BC103517 BC103519 BC103520 CH466614 S74520 U00454 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA19645 AAB32251 AAI03517 AAI03518 AAI03520 AAI03521 BAC33814 EDL05830 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||