Mus musculus Protein: Irf7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-212083.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Irf7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | interferon regulatory factor 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000026571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-212081 (Irf7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Key transcriptional regulator of type I interferon (IFN)-dependent immune responses and plays a critical role in the innate immune response against DNA and RNA viruses. Regulates the transcription of type I IFN genes (IFN-alpha and IFN-beta) and IFN-stimulated genes (ISG) by binding to an interferon-stimulated response element (ISRE) in their promoters. Can efficiently activate both the IFN-beta (IFNB) and the IFN-alpha (IFNA) genes and mediate their induction via both the virus-activated, MyD88- independent pathway and the TLR-activated, MyD88-dependent pathway. Required during both the early and late phases of the IFN gene induction but is more critical for the late than for the early phase. Exists in an inactive form in the cytoplasm of uninfected cells and following viral infection, double-stranded RNA (dsRNA), or toll-like receptor (TLR) signaling, becomes phosphorylated by IKBKE and TBK1 kinases. This induces a conformational change, leading to its dimerization and nuclear localization where along with other coactivators it can activate transcription of the type I IFN and ISG genes. Can also play a role in regulating adaptive immune responses by inducing PSMB9/LMP2 expression, either directly or through induction of IRF1. Binds to the Q promoter (Qp) of EBV nuclear antigen 1 a (EBNA1) and may play a role in the regulation of EBV latency. Can activate distinct gene expression programs in macrophages and regulate the anti-tumor properties of primary macrophages. {ECO:0000269PubMed:15361868, ECO:0000269PubMed:15743772, ECO:0000269PubMed:15800576, ECO:0000269PubMed:18562536}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:15361868}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:15361868}. Note=The phosphorylated and active form accumulates selectively in the nucleus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 59 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1859212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001346
Interferon regulatory factor DNA-binding domain IPR008984 SMAD/FHA domain IPR019471 Interferon regulatory factor-3 |
||||||||||||||||||||||||||||||||
PFAM |
PF00605
PF10401 |
||||||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS |
PR00267
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00348
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P70434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P70434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q542T3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_058546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI ID | 3QU3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Irf7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK079685 AK150403 AK150608 AK152401 AK153054 BC138799 CH466531 U73037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB18626 AAI38800 BAC37723 BAE29529 BAE29699 BAE31189 BAE31680 EDL18031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||