Homo sapiens Protein: PXDNL | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-21308.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PXDNL | ||||||||||||||||||
Protein Name | peroxidasin homolog (Drosophila)-like | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000348645 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-21306 (PXDNL) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Isoform PMR1: Endonuclease selectively degrading some target mRNAs while they are engaged by translating ribosomes, among which albumin and beta-globin mRNAs. {ECO:0000269PubMed:22543864}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted {ECO:0000305}.Isoform PMR1: Cytoplasm. Note=Associates with polysomes. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | the 57 kDa isoform PMR1 is the only form detected at protein levels in human cell lines. {ECO:0000269PubMed:22543864}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001007 von Willebrand factor, type C IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR003598 Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR010255 Haem peroxidase IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin IPR019791 Haem peroxidase, animal |
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PFAM |
PF01463
PF00093 PF00560 PF13504 PF13855 PF07679 PF07686 PF00047 PF03098 |
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PRINTS |
PR00457
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PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00082
SM00214 SM00369 SM00408 SM00409 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | A1KZ92 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-A1KZ92 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 137902 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.444882 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_653252 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:26359 | ||||||||||||||||||
OMIM | 615904 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47855 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08693 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC011128 AC012413 AC090186 AC103958 AC107374 AK058200 AK131524 AY877349 CH471068 EU170240 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAX70929 ABX24517 BAB71713 BAD18663 EAW86707 | ||||||||||||||||||