Homo sapiens Protein: BBS4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-240024.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BBS4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Bardet-Biedl syndrome 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000378631 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-20881 (BBS4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | The BBSome complex is thought to function as a coat complex required for sorting of specific membrane proteins to the primary cilia. The BBSome complex is required for ciliogenesis but is dispensable for centriolar satellite function. This ciliogenic function is mediated in part by the Rab8 GDP/GTP exchange factor, which localizes to the basal body and contacts the BBSome. Rab8(GTP) enters the primary cilium and promotes extension of the ciliary membrane. Firstly the BBSome associates with the ciliary membrane and binds to RAB3IP/Rabin8, the guanosyl exchange factor (GEF) for Rab8 and then the Rab8-GTP localizes to the cilium and promotes docking and fusion of carrier vesicles to the base of the ciliary membrane. The BBSome complex, together with the LTZL1, controls SMO ciliary trafficking and contributes to the sonic hedgehog (SHH) pathway regulation. Required for proper BBSome complex assembly and its ciliary localization. Required for microtubule anchoring at the centrosome but not for microtubule nucleation. May be required for the dynein-mediated transport of pericentriolar proteins to the centrosome. {ECO:0000269PubMed:15107855, ECO:0000269PubMed:17574030, ECO:0000269PubMed:22072986}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome. Cytoplasm, cytoskeleton. Cell projection, cilium membrane. Cytoplasm. Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriolar satellite. Cell projection, cilium, flagellum {ECO:0000250}. Note=Localizes to the pericentriolar region throughout the cell cycle. Centrosomal localization requires dynein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Bardet-Biedl syndrome 4 (BBS4) [MIM:209900]: A syndrome characterized by usually severe pigmentary retinopathy, early- onset obesity, polydactyly, hypogenitalism, renal malformation and mental retardation. Secondary features include diabetes mellitus, hypertension and congenital heart disease. Bardet-Biedl syndrome inheritance is autosomal recessive, but three mutated alleles (two at one locus, and a third at a second locus) may be required for clinical manifestation of some forms of the disease. {ECO:0000269PubMed:11381270, ECO:0000269PubMed:12016587, ECO:0000269PubMed:12677556, ECO:0000269PubMed:12872256, ECO:0000269PubMed:15666242, ECO:0000269PubMed:15770229}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed. The highest level of expression is found in the kidney. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 32 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 9 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001440
Tetratricopeptide TPR1 IPR013026 Tetratricopeptide repeat-containing domain IPR019734 Tetratricopeptide repeat |
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PFAM |
PF00515
PF13174 PF13176 PF13181 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00028
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q96RK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96RK4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.208681 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001239607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:969 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600374 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS58377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC009712 AF359281 AK075321 AK303706 AY457143 BC008923 BC027624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH08923 AAH27624 AAK58868 AAS13441 BAC11547 BAG64690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||