Homo sapiens Protein: CLDN7 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-24060.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLDN7 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | claudin 7 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CEPTRL2; claudin-1; CLDN-7; CPETRL2; Hs.84359; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000353475 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-24056 (CLDN7) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Plays a major role in tight junction-specific obliteration of the intercellular space. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cell membrane; Multi-pass membrane protein. Lateral cell membrane. Cell junction, tight junction. Note=Co- localizes with EPCAM at the lateral cell membrane and tight junction. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in kidney, lung and prostate. Isoform 1 seems to be predominant, except in some normal prostate samples, where isoform 2 is the major form. Down-regulated in breast cancers, including ductal carcinoma in situ (DCIS), lobular carcinoma in situ (LCIS) and invasive ductal carcinoma (IDC) (at protein level), as well as in several cancer cell lines. Loss of expression correlates with histological grade, occurring predominantly in high-grade lesions. {ECO:0000269PubMed:12673207, ECO:0000269PubMed:14502431}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 8 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003552
Claudin-7 IPR004031 PMP-22/EMP/MP20/Claudin superfamily IPR006187 Claudin |
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PFAM |
PF00822
PF13903 |
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PRINTS |
PR01381
PR01077 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95471 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O95471 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EP40 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1366 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.733833 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001298 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2049 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 609131 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11096 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 07633 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC003688 AF093823 AJ011497 AK313958 BC001055 BC071844 BT006829 CH471108 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH01055 AAH71844 AAP35475 AAP97219 BAG36674 CAA09626 EAW90228 EAW90229 | ||||||||||||||||||||||