Mus musculus Protein: Son | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-252611.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Son | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | Son DNA binding protein | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 2900011L12Rik; AA409051; AU067731; C81487; mKIAA1019; nrebp; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000109671 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-176345 (Son) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that acts as a mRNA splicing cofactor by promoting efficient splicing of transcripts that possess weak splice sites. Specifically promotes splicing of many cell-cycle and DNA-repair transcripts that possess weak splice sites, such as TUBG1, KATNB1, TUBGCP2, AURKB, PCNT, AKT1, RAD23A, and FANCG. Probably acts by facilitating the interaction between Serine/arginine-rich proteins such as SRSF2 and the RNA polymerase II. Also binds to DNA; binds to the consensus DNA sequence: 5'- GA[GT]AN[CG][AG]CC-3' (By similarity). May also regulate the ghrelin signaling in hypothalamic neuron by acting as a negative regulator of GHSR expression. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:20876580}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Colocalizes with the pre-mRNA splicing factor SRSF2. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed. Highly expressed in brain, heart, spleen, liver, skeletal muscle, kidney and testis. {ECO:0000269PubMed:20876580}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 13 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 54 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:98353 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000467
G-patch domain IPR014720 Double-stranded RNA-binding domain IPR017986 WD40-repeat-containing domain |
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PFAM |
PF01585
PF00035 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00443
SM00358 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9QX47 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9QX47 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8BM30 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 20658 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.46401 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_849211 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Son | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS37399 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB546195 AC131691 AF193595 AF193596 AF193597 AF193598 AF193599 AF193600 AF193601 AF193602 AF193603 AF193604 AF193605 AF193606 AF193607 AK008256 AK008478 AK019081 AK019312 AK035150 BC046419 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF23120 AAF23121 AAH46419 BAB25562 BAB25691 BAB31536 BAB31659 BAC28960 BAJ40169 | ||||||||||||||||||||||