Mus musculus Protein: Lhx6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-254874.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Lhx6 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | LIM homeobox protein 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Lhx6.1; | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000108585 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-164971 (Lhx6) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Probable transcription factor required for the expression of a subset of genes involved in interneurons migration and development. Functions in the specification of cortical interneuron subtypes and in the migration of GABAergic interneuron precursors from the subpallium to the cerebral cortex. {ECO:0000269PubMed:10393337, ECO:0000269PubMed:15201337, ECO:0000269PubMed:17376969, ECO:0000269PubMed:18339674, ECO:0000269PubMed:18613121}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Brain specific. Expressed by neurons in the amygdala that are activated by reproductive olfactory stimuli and project in regions of the hypothalamus involved in reproduction (at protein level). {ECO:0000269PubMed:10393337, ECO:0000269PubMed:15944132}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1306803 | ||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR001781 Zinc finger, LIM-type IPR009057 Homeodomain-like |
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PFAM |
PF00046
PF00412 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
SM00132 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9R1R0 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 16874 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Mm.12881 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001076595 | ||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | Lhx6 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS38113 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB031039 AB031040 AJ000337 AL773525 BC065077 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH65077 BAA83420 BAA83421 CAA04011 CAM16137 | ||||||||||||||||||||||