Version 5.4
| Mus musculus Protein: Cwc22 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-257299.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | Cwc22 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | CWC22 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | AA684037; AI173004; AL022752; B230213M24; mKIAA1604; | ||||||||||||||||||
| Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000107452 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-183030 (Cwc22) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Required for pre-mRNA splicing and for exon-junction complex (EJC) assembly. Hinders EIF4A3 from non-specifically binding RNA and escorts it to the splicing machinery to promote EJC assembly on mature mRNAs. Through its role in EJC assembly, required for nonsense-mediated mRNA decay (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000250}. Nucleus speckle {ECO:0000250}. Note=Concentrates around speckles, which are sites of pre-mRNA synthesis and processing, where it colocalizes with EJC core proteins. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | MGI:2136773 | ||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003890
MIF4G-like, type 3 IPR003891 Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 IPR016024 Armadillo-type fold |
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| PFAM |
PF02854
PF02847 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00543
SM00544 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q8C5N3 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q8C5N3 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | Q8BKP8 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 80744 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.482707 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | XP_006500497 | ||||||||||||||||||
| MGI ID | |||||||||||||||||||
| MGI Symbol | Cwc22 | ||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS16165 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AK045589 AK051237 AK077961 AK132001 AK149528 AL928791 AL928915 BC003993 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH03993 BAC32427 BAC34567 BAC37085 BAE20931 BAE28941 | ||||||||||||||||||