Homo sapiens Protein: PYCARD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-28016.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PYCARD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | PYD and CARD domain containing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000340441 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-28012 (PYCARD) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Functions as key mediator in apoptosis and inflammation. Promotes caspase-mediated apoptosis involving predominantly caspase-8 and also caspase-9 in a probable cell type-specific manner. Involved in activation of the mitochondrial apoptotic pathway, promotes caspase-8-dependent proteolytic maturation of BID independently of FADD in certain cell types and also mediates mitochondrial translocation of BAX and activates BAX-dependent apoptosis coupled to activation of caspase-9, -2 and -3. Involved in macrophage pyroptosis, a caspase-1-dependent inflammatory form of cell death and is the major constituent of the ASC pyroptosome which forms upon potassium depletion and rapidly recruits and activates caspase-1. In innate immune response believed to act as an integral adapter in the assembly of the inflammasome which activates caspase-1 leading to processing and secretion of proinflammatory cytokines. The function as activating adapter in different types of inflammasomes is mediated by the DAPIN and CARD domains and their homotypic interactions. Required for recruitment of caspase-1 to inflammasomes containing certain pattern recognition receptors, such as NLRP2, NLRP3, AIM2 and probably IFI16. In the NLRP1 and NLRC4 inflammasomes seems not be required but facilitates the processing of procaspase-1. In cooperation with NOD2 involved in an inflammasome activated by bacterial muramyl dipeptide leading to caspase-1 activation. May be involved in DDX58-triggered proinflammatory responses and inflammasome activation. Isoform 2 may have a regulating effect on the function as inflammasome adapter. Isoform 3 seems to inhibit inflammasome- mediated maturation of interleukin-1 beta. In collaboration with AIM2 which detects cytosolic double-stranded DNA may also be involved in a caspase-1-independent cell death that involves caspase-8. In adaptive immunity may be involved in maturation of dendritic cells to stimulate T-cell immunity and in cytoskeletal rearrangements coupled to chemotaxis and antigen uptake may be involved in post-transcriptional regulation of the guanine nucleotide exchange factor DOCK2; the latter function is proposed to involve the nuclear form. Also involved in transcriptional activation of cytokines and chemokines independent of the inflammasome; this function may involve AP-1, NF-kappa-B, MAPK and caspase-8 signaling pathways. For regulation of NF-kappa-B activating and inhibiting functions have been reported. Modulates NF-kappa-B induction at the level of the IKK complex by inhibiting kinase activity of CHUK and IKBK. Proposed to compete with RIPK2 for association with CASP1 thereby down-regulating CASP1-mediated RIPK2-dependent NF-kappa-B activation and activating interleukin-1 beta processing. {ECO:0000269PubMed:11103777, ECO:0000269PubMed:12486103, ECO:0000269PubMed:12646168, ECO:0000269PubMed:14499617, ECO:0000269PubMed:14730312, ECO:0000269PubMed:15030775, ECO:0000269PubMed:16585594, ECO:0000269PubMed:16964285, ECO:0000269PubMed:16982856, ECO:0000269PubMed:17349957, ECO:0000269PubMed:17599095, ECO:0000269PubMed:19158675, ECO:0000269PubMed:19158676, ECO:0000269PubMed:19234215, ECO:0000269PubMed:19494289, ECO:0000269PubMed:21487011, ECO:0000269PubMed:22732093}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Endoplasmic reticulum. Mitochondrion. Nucleus. Note=Upstream of caspase activation, a redistribution from the cytoplasm to the aggregates occurs. These appear as hollow, perinuclear spherical, ball-like structures. Upon NLRP3 inflammasome activation redistributes to the perinuclear space localizing to endoplasmic reticulum and mitochondria. Localized primarily to the nucleus in resting monocytes/macrophages and rapidly redistributed to the cytoplasm upon pathogen infection. Localized to large cytoplasmic aggregate appearing as a speck containing AIM2, PYCARD, CASP8 and bacterial DNA after infection with Francisella tularensis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed at low levels. Detected in peripheral blood leukocytes, lung, small intestine, spleen, thymus, colon and at lower levels in placenta, liver and kidney. Very low expression in skeletal muscle, heart and brain. Detected in the leukemia cell lines HL-60 and U-937, but not in Jurkat T- cell lymphoma and Daudi Burkitt's lymphoma. Detected in the melanoma cell line WM35, but not in WM793. Not detected in HeLa cervical carcinoma cells and MOLT-4 lymphocytic leukemia cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 48 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001315
CARD domain IPR004020 DAPIN domain IPR011029 Death-like domain |
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PFAM |
PF00619
PF02758 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00114
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9ULZ3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9ULZ3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 29108 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_660183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB023416 AF184072 AF184073 AF255794 AF310103 AF384665 AK000211 BC004470 BC013569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF99665 AAG01187 AAG01188 AAG30286 AAH04470 AAH13569 AAK63850 BAA87339 BAA91012 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||