Version 5.4
| Homo sapiens Protein: SDK1 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-292567.5 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | SDK1 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | sidekick homolog 1, cell adhesion molecule (chicken) | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000385899 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-7180 (SDK1) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Cell adhesion protein that guides axonal terminals to specific synapses in developing neurons. Dysregulation of this protein may play an important role in podocyte dysfunction in HIV- associated nephropathy. {ECO:0000269PubMed:15213259}. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Membrane {ECO:0000305}; Single-pass membrane protein {ECO:0000305}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Up-regulated in glomeruli in HIV-associated nephropathy. In diseased glomeruli, significantly overexpressed and the expression is no longer restricted to mesangial cells but includes podocytes and parietal epithelial cells. {ECO:0000269PubMed:15213259}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR003598
Immunoglobulin subtype 2 IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR003961 Fibronectin, type III IPR007110 Immunoglobulin-like domain IPR013098 Immunoglobulin I-set IPR013106 Immunoglobulin V-set domain IPR013151 Immunoglobulin |
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| PFAM |
PF00041
PF01108 PF07679 PF07686 PF00047 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00408
SM00409 SM00060 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q7Z5N4 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q7Z5N4 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 221935 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.655699 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_689957 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:19307 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 607216 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS34590 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 07388 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AC004935 AC004984 AC011284 AC015968 AC069286 AC073316 AC073550 AC079231 AC092427 AK055987 AK074077 AK074083 AY310398 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAP75619 BAB71066 BAB84903 BAB84909 | ||||||||||||||||||