Homo sapiens Protein: INO80 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-292765.4 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | INO80 | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | INO80 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000384686 | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-6884 (INO80) | ||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Function | DNA helicase and probable main scaffold component of the chromatin remodeling INO80 complex which is involved in transcriptional regulation, DNA replication and probably DNA repair; according to PubMed:20687897 the contribution to DNA double-strand break repair appears to be largely indirect through transcriptional regulation. Recruited by YY1 to YY1-activated genes, where it acts as an essential coactivator. Binds DNA. In vitro, has double-stranded DNA-dependent ATPase activity. Involved in UV-damage excision repair, DNA replication and chromosome segregation during normal cell division cycle. {ECO:0000269PubMed:16230350, ECO:0000269PubMed:16298340, ECO:0000269PubMed:17721549, ECO:0000269PubMed:20237820, ECO:0000269PubMed:20687897, ECO:0000269PubMed:20855601, ECO:0000269PubMed:21303910}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00746, ECO:0000269PubMed:16298340, ECO:0000269PubMed:18026119, ECO:0000269PubMed:20971067}. Note=Colocalizes with PCNA at replication forks during S-phase. Recruited to DNA damage sites in a ACTR8-dependent manner. | ||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | According to PubMed:10574462, widely expressed. According to PubMed:16298340, specifically expressed in brain, liver and pancreas. {ECO:0000269PubMed:10574462, ECO:0000269PubMed:16298340}. | ||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 35 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000330
SNF2-related IPR001650 Helicase, C-terminal IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00176
PF00271 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9ULG1 | ||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9ULG1 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9NUK2 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 54617 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.606817 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | |||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:26956 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 610169 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10071 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 10024 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB033085 AK002176 AL137280 BC146785 CH471125 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAI46786 BAA86573 BAA92122 CAB70675 EAW92469 EAW92470 | ||||||||||||||||||||||||||||