Homo sapiens Protein: CWC22 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-293398.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | CWC22 | ||||||||||||||||||
Protein Name | CWC22 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000387006 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-76644 (CWC22) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Required for pre-mRNA splicing and for exon-junction complex (EJC) assembly. Hinders EIF4A3 from non-specifically binding RNA and escorts it to the splicing machinery to promote EJC assembly on mature mRNAs. Through its role in EJC assembly, required for nonsense-mediated mRNA decay. {ECO:0000269PubMed:22959432, ECO:0000269PubMed:22961380, ECO:0000269PubMed:23236153}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Nucleus speckle. Note=Concentrates around speckles, which are sites of pre-mRNA synthesis and processing, where it colocalizes with EJC core proteins. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 20 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR003890
MIF4G-like, type 3 IPR003891 Initiation factor eIF-4 gamma, MA3 IPR016024 Armadillo-type fold |
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PFAM |
PF02854
PF02847 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00543
SM00544 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9HCG8 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9HCG8 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | B7WP74 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57703 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.614681 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_065994 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:29322 | ||||||||||||||||||
OMIM | 615186 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS46465 | ||||||||||||||||||
HPRD | 17220 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB046824 AC068194 AC096587 AK025635 AK026978 BC016651 BC031216 BC053573 BC057826 BC093952 BC093954 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH16651 AAH31216 AAH53573 AAH57826 AAH93952 AAH93954 BAB13430 BAB15197 BAB15612 | ||||||||||||||||||