Homo sapiens Protein: MBD5 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-294093.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | MBD5 | ||||||||||||||||||
Protein Name | methyl-CpG binding domain protein 5 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000386049 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-71831 (MBD5) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Binds to heterochromatin. Does not interact with either methylated or unmethylated DNA (in vitro). | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Isoform 1: Nucleus. Chromosome. Note=Associated with pericentric heterochromatin.Isoform 2: Nucleus. Note=Not associated with pericentric heterochromatin. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | Mental retardation, autosomal dominant 1 (MRD1) [MIM:156200]: A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. {ECO:0000269PubMed:17847001}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in heart, placenta, liver, skeletal muscle, kidney and pancreas. {ECO:0000269PubMed:12529184}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000313
PWWP domain IPR001739 Methyl-CpG DNA binding IPR016177 DNA-binding domain |
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PFAM |
PF00855
PF01429 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00293
SM00391 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9P267 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9P267 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55777 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.604917 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_060798 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20444 | ||||||||||||||||||
OMIM | 611472 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33302 | ||||||||||||||||||
HPRD | 11295 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AB040894 AC016731 AK001975 BC014534 BC150264 CH471058 EF542797 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAI50265 AAY14912 ABQ18300 BAA92013 BAA95985 EAX11552 | ||||||||||||||||||