Homo sapiens Protein: NTN1 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-29665.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NTN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | netrin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NTN1L; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000173229 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-29663 (NTN1) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Netrins control guidance of CNS commissural axons and peripheral motor axons. Its association with either DCC or some UNC5 receptors will lead to axon attraction or repulsion, respectively. It also serve as a survival factor via its association with its receptors which prevent the initiation of apoptosis. Involved in tumorigenesis by regulating apoptosis. {ECO:0000269PubMed:15343335}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted, extracellular space, extracellular matrix {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Widely expressed in normal adult tissues with highest levels in heart, small intestine, colon, liver and prostate. Reduced expression in brain tumors and neuroblastomas. Expressed in epididymis (at protein level). {ECO:0000269PubMed:20736409, ECO:0000269PubMed:9950216}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001134
Netrin domain IPR002049 EGF-like, laminin IPR008211 Laminin, N-terminal IPR008979 Galactose-binding domain-like IPR008993 Tissue inhibitor of metalloproteinases-like, OB-fold IPR018933 Netrin module, non-TIMP type |
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PFAM |
PF00053
PF00055 PF01759 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00180
SM00136 SM00643 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O95631 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O95631 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9423 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.660885 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004813 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8029 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601614 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11148 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03368 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC005695 AC090610 GU727649 U75586 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD09221 ADU87650 | ||||||||||||||||||||||||||||||