Homo sapiens Protein: BLM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-30369.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BLM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Bloom syndrome, RecQ helicase-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BS; RECQ2; RECQL2; RECQL3; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000347232 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-30365 (BLM) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Participates in DNA replication and repair. Exhibits a magnesium-dependent ATP-dependent DNA-helicase activity that unwinds single- and double-stranded DNA in a 3'-5' direction. Involved in 5'-end resection of DNA during double-strand break (DSB) repair: unwinds DNA and recruits DNA2 which mediates the cleavage of 5'-ssDNA. Negatively regulates sister chromatid exchange (SCE). {ECO:0000269PubMed:12019152, ECO:0000269PubMed:21325134, ECO:0000269PubMed:23509288, ECO:0000269PubMed:9388193}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:23509288}. Note=Together with SPIDR, is redistributed in discrete nuclear DNA damage-induced foci following hydroxyurea (HU) or camptothecin (CPT) treatment. Accumulated at sites of DNA damage in a RMI complex- and SPIDR-dependent manner. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Bloom syndrome (BLM) [MIM:210900]: An autosomal recessive disorder. It is characterized by proportionate pre- and postnatal growth deficiency, sun-sensitive telangiectatic hypo- and hyperpigmented skin, predisposition to malignancy, and chromosomal instability. {ECO:0000269PubMed:10862105, ECO:0000269PubMed:7585968, ECO:0000269PubMed:9285778}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 112 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR002121 HRDC domain IPR004589 DNA helicase, ATP-dependent, RecQ type IPR010997 HRDC-like IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR012532 BDHCT IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR018982 RQC domain IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00570 PF00270 PF08072 PF09382 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00341 SM00487 SM00956 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P54132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P54132 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.725208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001274177 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10363 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05211 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY886902 BC093622 BC101567 BC115030 BC115032 U39817 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA87850 AAH93622 AAI01568 AAI15031 AAI15033 AAW62255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||