Homo sapiens Protein: DDX39A | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-33230.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | DDX39A | ||||||||||||||||||
Protein Name | DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39A | ||||||||||||||||||
Synonyms | BAT1; BAT1L; DDX39; DDXL; URH49; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000242776 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33228 (DDX39A) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Involved in pre-mRNA splicing. Required for the export of mRNA out of the nucleus. {ECO:0000269PubMed:15047853}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:21859714}. Cytoplasm {ECO:0000269PubMed:21859714}. Note=Can translocate to the cytoplasm in the presence of MX1. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Detected in testis, and at lower levels in brain, kidney, lung, thymus, spleen and salivary gland. {ECO:0000269PubMed:15047853}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 44 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001650
Helicase, C-terminal IPR011545 DEAD/DEAH box helicase domain IPR014001 Helicase, superfamily 1/2, ATP-binding domain IPR014014 RNA helicase, DEAD-box type, Q motif IPR027417 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase |
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PFAM |
PF00271
PF00270 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00490
SM00487 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | O00148 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O00148 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | K7ENP6 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10212 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.311609 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_005795 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17821 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12308 | ||||||||||||||||||
HPRD | 10861 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC008569 AK026614 BC001009 BC032128 CH471106 U90426 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB50231 AAH01009 AAH32128 BAB15509 EAW84417 | ||||||||||||||||||