Homo sapiens Protein: SETDB2 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-33317.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | SETDB2 | ||||||||||||||||||
Protein Name | SET domain, bifurcated 2 | ||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000326477 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-33315 (SETDB2) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Histone methyltransferase involved in left-right axis specification in early development and mitosis. Specifically trimethylates 'Lys-9' of histone H3 (H3K9me3). H3K9me3 is a specific tag for epigenetic transcriptional repression that recruits HP1 (CBX1, CBX3 and/or CBX5) proteins to methylated histones. Contributes to H3K9me3 in both the interspersed repetitive elements and centromere-associated repeats. Plays a role in chromosome condensation and segregation during mitosis. {ECO:0000269PubMed:20404330}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:20404330}. Chromosome {ECO:0000305PubMed:20404330}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. Highest expression in heart, testis and ovary. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 4 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001214
SET domain IPR001739 Methyl-CpG DNA binding IPR003606 Pre-SET zinc-binding sub-group IPR007728 Pre-SET domain IPR016177 DNA-binding domain |
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PFAM |
PF00856
PF01429 PF05033 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00317
SM00391 SM00468 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q96T68 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q96T68 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | Q8NDJ9 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 83852 | ||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001153780 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:20263 | ||||||||||||||||||
OMIM | 607865 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS53868 | ||||||||||||||||||
HPRD | 09712 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF334407 AL136218 AL139321 AL831937 AL833957 BC017078 BC047434 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH17078 AAH47434 AAK38373 CAD38807 CAH56265 CAH71048 CAI10817 CAI10818 | ||||||||||||||||||