Version 5.4
| Homo sapiens Protein: AMIGO2 | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Protein | IDBP-373151.4 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | AMIGO2 | ||||||||||||||||||
| Protein Name | adhesion molecule with Ig-like domain 2 | ||||||||||||||||||
| Synonyms | |||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Protein | ENSP00000406020 | ||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-28724 (AMIGO2) | ||||||||||||||||||
| Protein Structure |
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| UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
| Function | Required for depolarization-dependent survival of cultured cerebellar granule neurons. May mediate homophilic as well as heterophilic cell-cell interaction with AMIGO1 or AMIGO3. May contribute to signal transduction through its intracellular domain. May be required for tumorigenesis of a subset of gastric adenocarcinomas. | ||||||||||||||||||
| Subcellular Localization | Cell membrane {ECO:0000250}; Single-pass type I membrane protein {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000250}. Note=Associated with nucleus as well as plasma membrane. Restricted to somata of cerebellar as well as hippocampal neurons (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
| Disease Associations | |||||||||||||||||||
| Tissue Specificity | Highest levels in breast, ovary, cervix, and uterus. Lower levels in lung, colon, and rectum. Differentially expressed in 56% of thyroid, 57% of pancreatic and 45% of stomach cancers. {ECO:0000269PubMed:15107827}. | ||||||||||||||||||
| Comments | |||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
| PDB ID | |||||||||||||||||||
| InterPro |
IPR000483
Cysteine-rich flanking region, C-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR003599 Immunoglobulin subtype IPR007110 Immunoglobulin-like domain |
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| PFAM |
PF01463
PF00560 PF13504 PF13855 |
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| PRINTS | |||||||||||||||||||
| PIRSF | |||||||||||||||||||
| SMART |
SM00082
SM00369 SM00409 |
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| TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
| Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
| Modification | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | Q86SJ2 | ||||||||||||||||||
| PhosphoSite | PhosphoSite-Q86SJ2 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | B3KS95 | ||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 347902 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.121520 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001137140 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:24073 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 615690 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS8751 | ||||||||||||||||||
| HPRD | 16483 | ||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AB079074 AB080610 AK093111 AL833007 AY237005 AY454159 BC014103 BC047595 BC095477 CH471111 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAH14103 AAH47595 AAH95477 AAO48946 AAR83271 BAC81188 BAC81189 BAG52657 CAH56293 EAW57924 | ||||||||||||||||||