Homo sapiens Protein: RBFOX2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-374372.4 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBFOX2 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 2 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | dJ106I20.3; Fox-2; FOX2; fxh; HNRBP2; HRNBP2; RBM9; RTA; | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000413035 | ||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5580 (RBFOX2) | ||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||
Function | RNA-binding protein that regulates alternative splicing events by binding to 5'-UGCAUGU-3' elements. Prevents binding of U2AF2 to the 3'-splice site. Regulates alternative splicing of tissue-specific exons and of differentially spliced exons during erythropoiesis (By similarity). RNA-binding protein that seems to act as a coregulatory factor of ER-alpha. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:11875103}. | ||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus. Cytoplasm {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 68 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR017325 RNA binding protein Fox-1 IPR025670 Fox-1 C-terminal domain |
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PFAM |
PF00076
PF12414 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF037932
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SMART |
SM00360
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | O43251 | ||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-O43251 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 23543 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.713722 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001076048 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9906 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 612149 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS43013 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15231 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF229058 AK055213 AK291460 AL009266 AL049748 AL079295 AM419009 AY072786 AY960684 BC013115 BC025281 CR456559 DQ778625 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH13115 AAH25281 AAL67150 AAL71905 AAX84843 ABG77459 BAB70875 BAF84149 CAA15842 CAG30445 CAI19059 CAL91352 CAQ07599 CAQ07600 | ||||||||||||||||||||||||