Homo sapiens Protein: GABARAPL2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-42627.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | GABARAPL2 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | GABA(A) receptor-associated protein-like 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | ATG8; ATG8C; GATE-16; GATE16; GEF-2; GEF2; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000037243 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-42625 (GABARAPL2) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Ubiquitin-like modifier involved in intra-Golgi traffic. Modulates intra-Golgi transport through coupling between NSF activity and SNAREs activation. It first stimulates the ATPase activity of NSF which in turn stimulates the association with GOSR1 (By similarity). Involved in autophagy. Plays a role in mitophagy which contributes to regulate mitochondrial quantity and quality by eliminating the mitochondria to a basal level to fulfill cellular energy requirements and preventing excess ROS production. Whereas LC3s are involved in elongation of the phagophore membrane, the GABARAP/GATE-16 subfamily is essential for a later stage in autophagosome maturation. {ECO:0000250, ECO:0000269PubMed:20418806, ECO:0000269PubMed:23209295}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Golgi apparatus {ECO:0000250}. Cytoplasmic vesicle, autophagosome {ECO:0000269PubMed:12507496, ECO:0000269PubMed:15169837, ECO:0000269PubMed:17580304, ECO:0000269PubMed:19056683, ECO:0000269PubMed:22311637}. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitous. Expressed at high levels in the brain, heart, prostate, ovary, spleen and skeletal muscle. Expressed at very low levels in lung, thymus and small intestine. {ECO:0000269PubMed:11146101, ECO:0000269PubMed:11414770}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 90 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR004241
Autophagy protein Atg8 ubiquitin like IPR007242 Ubiquitin-like protein Atg12 IPR029071 Ubiquitin-related domain |
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PFAM |
PF02991
PF04110 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P60520 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P60520 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | H3BQ50 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11345 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.659651 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_009216 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:13291 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 607452 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10921 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16246 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB030710 AC025287 AF077046 AF087848 AJ010569 AK289788 BC005985 BC014594 BC029601 CH471114 CR542217 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAD27779 AAH05985 AAH14594 AAH29601 AAK20400 BAB21548 BAF82477 CAA09249 CAG47013 EAW95630 | ||||||||||||||||||||||