Homo sapiens Protein: SHROOM2 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-42700.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SHROOM2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | shroom family member 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | APXL; HSAPXL; | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000370299 | ||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-42698 (SHROOM2) | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||
Function | May be involved in endothelial cell morphology changes during cell spreading. In the retinal pigment epithelium, may regulate the biogenesis of melanosomes and promote their association with the apical cell surface by inducing gamma-tubulin redistribution (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Apical cell membrane {ECO:0000250}. Cell junction, tight junction {ECO:0000250}. Cytoplasm, cytoskeleton {ECO:0000250}. Note=Associates with cortical F-actin. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Abundant in retina and melanoma; also in brain, placenta, lung, kidney and pancreas. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001478
PDZ domain IPR014799 Apx/shroom, ASD2 IPR014800 Apx/shroom, ASD1 |
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PFAM |
PF00595
PF13180 PF08687 PF08688 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00228
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q13796 | ||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q13796 | ||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F5H3B6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 357 | ||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.567236 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001640 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:630 | ||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 300103 | ||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS14135 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 02113 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC002365 AC090481 AC135254 BC140866 X83543 | ||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC32592 AAI40867 CAA58534 | ||||||||||||||||||||||||||||||