Homo sapiens Protein: NEIL3 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-45524.5 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NEIL3 | ||||||||||||||||||||
Protein Name | nei endonuclease VIII-like 3 (E. coli) | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000264596 | ||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-45522 (NEIL3) | ||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||
Function | DNA glycosylase which prefers single-stranded DNA (ssDNA), or partially ssDNA structures such as bubble and fork structures, to double-stranded DNA (dsDNA). In vitro, displays strong glycosylase activity towards the hydantoin lesions spiroiminodihydantoin (Sp) and guanidinohydantoin (Gh) in both ssDNA and dsDNA; also recognizes FapyA, FapyG, 5-OHU, 5-OHC, 5- OHMH, Tg and 8-oxoA lesions in ssDNA. No activity on 8-oxoG detected. Also shows weak DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase activity. In vivo, appears to be the primary enzyme involved in removing Sp and Gh from ssDNA in neonatal tissues. Seems to be an important facilitator of cell proliferation in certain populations, for example neural stem/progenitor cells and tumor cells, suggesting a role in replication-associated DNA repair. {ECO:0000269PubMed:12433996, ECO:0000269PubMed:19170771, ECO:0000269PubMed:22569481, ECO:0000269PubMed:23755964}. | ||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000269PubMed:12433996}. | ||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed in keratinocytes and embryonic fibroblasts (at protein level). Also detected in thymus, testis and fetal lung primary fibroblasts. {ECO:0000269PubMed:12433996, ECO:0000269PubMed:16428305, ECO:0000269PubMed:19426544, ECO:0000269PubMed:22365498}. | ||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000214
Zinc finger, DNA glycosylase/AP lyase-type IPR001876 Zinc finger, RanBP2-type IPR010666 Zinc finger, GRF-type IPR010979 Ribosomal protein S13-like, H2TH IPR012319 DNA glycosylase/AP lyase, catalytic domain IPR015886 DNA glycosylase/AP lyase, H2TH DNA-binding |
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PFAM |
PF00641
PF06839 PF01149 PF06831 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||
SMART |
SM00547
SM00898 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q8TAT5 | ||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q8TAT5 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 55247 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.405467 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_060718 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:24573 | ||||||||||||||||||||
OMIM | 608934 | ||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3828 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 16407 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AB079071 AC027627 AK001720 BC025954 DQ310721 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAH25954 ABC40719 BAA91860 BAC06479 | ||||||||||||||||||||