Homo sapiens Protein: RXRA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-476267.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RXRA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | retinoid X receptor, alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NR2B1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000419692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-91747 (RXRA) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Receptor for retinoic acid. Retinoic acid receptors bind as heterodimers to their target response elements in response to their ligands, all-trans or 9-cis retinoic acid, and regulate gene expression in various biological processes. The RAR/RXR heterodimers bind to the retinoic acid response elements (RARE) composed of tandem 5'-AGGTCA-3' sites known as DR1-DR5. The high affinity ligand for RXRs is 9-cis retinoic acid. RXRA serves as a common heterodimeric partner for a number of nuclear receptors. The RXR/RAR heterodimers bind to the retinoic acid response elements (RARE) composed of tandem 5'-AGGTCA-3' sites known as DR1-DR5. In the absence of ligand, the RXR-RAR heterodimers associate with a multiprotein complex containing transcription corepressors that induce histone acetylation, chromatin condensation and transcriptional suppression. On ligand binding, the corepressors dissociate from the receptors and associate with the coactivators leading to transcriptional activation. The RXRA/PPARA heterodimer is required for PPARA transcriptional activity on fatty acid oxidation genes such as ACOX1 and the P450 system genes. {ECO:0000269PubMed:10195690, ECO:0000269PubMed:11162439, ECO:0000269PubMed:11915042, ECO:0000269PubMed:20215566}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00407, ECO:0000269PubMed:11915042}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Highly expressed in liver, also found in lung, kidney and heart. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 182 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 19 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000003
Retinoid X receptor/HNF4 IPR000536 Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core IPR001628 Zinc finger, nuclear hormone receptor-type IPR001723 Steroid hormone receptor IPR003068 Transcription factor COUP IPR003078 Retinoic acid receptor IPR008946 Nuclear hormone receptor, ligand-binding IPR021780 Nuclear/hormone receptor activator site AF-1 |
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PFAM |
PF00104
PF00105 PF11825 |
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PRINTS |
PR00545
PR00047 PR00398 PR01282 PR01292 |
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00430
SM00399 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P19793 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q6P3U7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.649320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_002948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 180245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01577 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB307705 AC156789 AK131192 AL354796 AL669970 AL683798 BC063827 BC110998 CH471090 DQ303444 HQ692843 X52773 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH63827 AAI10999 ABB96254 ADZ17354 BAG54745 BAH02296 CAA36982 CAH70571 CAM45733 EAW88123 EAW88124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||