Homo sapiens Protein: NXF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-584372.3 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NXF1 | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | nuclear RNA export factor 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | MEX67; TAP; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000453885 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-51882 (NXF1) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Involved in the nuclear export of mRNA species bearing retroviral constitutive transport elements (CTE) and in the export of mRNA from the nucleus to the cytoplasm (TAP/NFX1 pathway). The NXF1-NXT1 heterodimer is involved in the export of HSP70 mRNA in conjunction with ALYREF/THOC4 and THOC5 components of the TREX complex. ALYREF/THOC4-bound mRNA is thought to be transferred to the NXF1-NXT1 heterodimer for export. {ECO:0000269PubMed:18364396, ECO:0000269PubMed:19165146, ECO:0000269PubMed:9660949}. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus, nucleoplasm. Nucleus speckle. Cytoplasm. Note=Localized predominantly in the nucleoplasm and at both the nucleoplasmic and cytoplasmic faces of the nuclear pore complex. Shuttles between the nucleus and the cytoplasm. Travels to the cytoplasm as part of the exon junction complex (EJC) bound to mRNA. The association with the TREX complex seems to occur in regions surrounding nuclear speckles known as perispeckles. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Expressed ubiquitously. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 129 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001611
Leucine-rich repeat IPR015245 Nuclear RNA export factor Tap, RNA-binding domain |
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PFAM |
PF00560
PF13504 PF13855 PF09162 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UBU9 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q9UBU9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q59E96 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10482 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.623481 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_001074960 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8071 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602647 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44629 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 04035 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB209915 AF112880 AF126246 AJ132712 AK027192 AK304082 AK304137 AK304743 AP001160 BC004904 BC028041 CH471076 U80073 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB81111 AAD20016 AAD39102 AAH04904 AAH28041 BAD93152 BAG64989 BAG65031 BAG65502 CAA10753 EAW74105 | ||||||||||||||||||||||