Homo sapiens Protein: HNF1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-61095.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | HNF1A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | HNF1 homeobox A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HNF-1A; HNF1; IDDM20; LFB1; MODY3; TCF-1; TCF1; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000257555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-61093 (HNF1A) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Function | Transcriptional activator that regulates the tissue specific expression of multiple genes, especially in pancreatic islet cells and in liver. Required for the expression of several liver specific genes. Binds to the inverted palindrome 5'- GTTAATNATTAAC-3'. {ECO:0000269PubMed:10966642, ECO:0000269PubMed:12453420}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Nucleus {ECO:0000255PROSITE- ProRule:PRU00108, ECO:0000269PubMed:10966642}. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Disease Associations | Hepatic adenomas familial (HEPAF) [MIM:142330]: Rare benign liver tumors of presumable epithelial origin that develop in an otherwise normal liver. Hepatic adenomas may be single or multiple. They consist of sheets of well-differentiated hepatocytes that contain fat and glycogen and can produce bile. Bile ducts or portal areas are absent. Kupffer cells, if present, are reduced in number and are non-functional. Conditions associated with adenomas are insulin-dependent diabetes mellitus and glycogen storage diseases (types 1 and 3). Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry. Bi-allelic inactivation of HNF1A, whether sporadic or associated with MODY3, may be an early step in the developmant of some hepatocellular carcinomas.Maturity-onset diabetes of the young 3 (MODY3) [MIM:600496]: A form of diabetes that is characterized by an autosomal dominant mode of inheritance, onset in childhood or early adulthood (usually before 25 years of age), a primary defect in insulin secretion and frequent insulin-independence at the beginning of the disease. {ECO:0000269PubMed:10078571, ECO:0000269PubMed:10102714, ECO:0000269PubMed:10482964, ECO:0000269PubMed:10588527, ECO:0000269PubMed:8945470, ECO:0000269PubMed:9032114, ECO:0000269PubMed:9075818, ECO:0000269PubMed:9075819, ECO:0000269PubMed:9097962, ECO:0000269PubMed:9166684, ECO:0000269PubMed:9287053, ECO:0000269PubMed:9392505, ECO:0000269PubMed:9626139, ECO:0000269PubMed:9754819}. Note=The disease is caused by mutations affecting the gene represented in this entry.Diabetes mellitus, insulin-dependent, 20 (IDDM20) [MIM:612520]: A multifactorial disorder of glucose homeostasis that is characterized by susceptibility to ketoacidosis in the absence of insulin therapy. Clinical features are polydipsia, polyphagia and polyuria which result from hyperglycemia-induced osmotic diuresis and secondary thirst. These derangements result in long-term complications that affect the eyes, kidneys, nerves, and blood vessels. {ECO:0000269PubMed:10333057, ECO:0000269PubMed:9313763, ECO:0000269PubMed:9867222}. Note=Disease susceptibility is associated with variations affecting the gene represented in this entry. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Liver. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 357 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001356
Homeobox domain IPR006897 Hepatocyte nuclear factor 1, beta isoform, C-terminal IPR006898 Hepatocyte nuclear factor 1, alpha isoform C-terminal IPR006899 Hepatocyte nuclear factor 1, N-terminal IPR009057 Homeodomain-like IPR010982 Lambda repressor-like, DNA-binding domain IPR023219 Hepatocyte nuclear factor 1, dimerisation domain |
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PFAM |
PF00046
PF04812 PF04813 PF04814 PF13413 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00389
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-P20823 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E0YMJ2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6927 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.654455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_000536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 142410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00800 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | FJ550192 FJ550194 FJ550195 FJ550197 FJ550200 FJ550201 FJ550202 FJ550204 FJ550205 FJ550206 FJ550207 FJ550208 HM116545 HM116546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | ACL15377 ACL15378 ACL15379 ACL15380 ACL15381 ACL15382 ACL15384 ACL15385 ACL15387 ACL15390 ACL15391 ACL15392 ADM43485 ADM43486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||