Mus musculus Protein: Alkbh8 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-620021.2 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | Alkbh8 | ||||||||||||||||||
Protein Name | alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli) | ||||||||||||||||||
Synonyms | 4930562C03Rik; 8030431D03Rik; 9430088N01Rik; Abh8; | ||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSMUSP00000125996 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-131121 (Alkbh8) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Catalyzes the methylation of 5-carboxymethyl uridine to 5-methylcarboxymethyl uridine at the wobble position of the anticodon loop in tRNA. Catalyzes the last step in the formation of 5-methylcarboxymethyl uridine at the wobble position of the anticodon loop in target tRNA. Has a preference for tRNA(Arg) and tRNA(Glu), and does not bind tRNA(Lys). Required for normal survival after DNA damage. May inhibit apoptosis and promote cell survival and angiogenesis (By similarity). {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm {ECO:0000250}. Nucleus {ECO:0000250}. Note=Predominantly cytoplasmic. {ECO:0000250}. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | |||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | MGI:1914917 | ||||||||||||||||||
InterPro |
IPR000504
RNA recognition motif domain IPR005123 Oxoglutarate/iron-dependent dioxygenase IPR007823 Methyltransferase-related IPR013216 Methyltransferase type 11 IPR015095 Alkylated DNA repair protein AlkB, homologue 8, N-terminal IPR029063 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase-like |
||||||||||||||||||
PFAM |
PF00076
PF03171 PF13640 PF05148 PF08241 PF09004 |
||||||||||||||||||
PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF | |||||||||||||||||||
SMART |
SM00360
|
||||||||||||||||||
TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q80Y20 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 67667 | ||||||||||||||||||
UniGene | Mm.402002 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_080579 | ||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||
MGI Symbol | Alkbh8 | ||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS22792 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AK020197 AK081459 AK160783 BC050863 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAH50863 BAB32026 BAC38223 BAE36007 | ||||||||||||||||||