Homo sapiens Protein: DEFA5 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-6201.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | DEFA5 | ||||||||||||||||||
Protein Name | defensin, alpha 5, Paneth cell-specific | ||||||||||||||||||
Synonyms | DEF5; HD-5; | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000329890 | ||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-6199 (DEFA5) | ||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||
Function | Has antimicrobial activity against Gram-negative and Gram-positive bacteria. Defensins are thought to kill microbes by permeabilizing their plasma membrane. All DEFA5 peptides exert antimicrobial activities, but their potency is affected by peptide processing. {ECO:0000269PubMed:12021776, ECO:0000269PubMed:15616305, ECO:0000269PubMed:17088326}. | ||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Secreted {ECO:0000269PubMed:12021776}. Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle {ECO:0000269PubMed:12021776}. Note=Peptides HD5(20-94), HD5(23- 94) and HD5(29-94) are found within tissues, HD5(20-94) being the predominant intracellular form. Peptides HD5(56-94) and HD5(63-94) are found in the extracellular milieu, HD5(63-94) being the most abundant form. | ||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Paneth cells of the small intestine (at protein level). {ECO:0000269PubMed:12021776}. | ||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||
InterPro |
IPR002366
Defensin propeptide IPR006080 Beta defensin/Neutrophil defensin IPR006081 Mammalian defensins IPR016327 Alpha-defensin |
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PFAM |
PF00879
PF00323 |
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PRINTS | |||||||||||||||||||
PIRSF |
PIRSF001875
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SMART |
SM00048
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q01523 | ||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite- | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 1670 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.655233 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NP_066290 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:2764 | ||||||||||||||||||
OMIM | 600472 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS5963 | ||||||||||||||||||
HPRD | 02720 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF238378 BC069690 BC107079 CH471153 M97925 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAA35754 AAH69690 AAI07080 AAT68886 EAW80489 | ||||||||||||||||||