Homo sapiens Protein: BPTF | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Protein | IDBP-65559.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | BPTF | ||||||||||||||||||||||
Protein Name | bromodomain PHD finger transcription factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | FAC1; FALZ; NURF301; | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein | ENSP00000315454 | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-65551 (BPTF) | ||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
UniProt Annotation | |||||||||||||||||||||||
Function | Histone-binding component of NURF (nucleosome-remodeling factor), a complex which catalyzes ATP-dependent nucleosome sliding and facilitates transcription of chromatin. Specifically recognizes H3 tails trimethylated on 'Lys-4' (H3K4me3), which mark transcription start sites of virtually all active genes. May also regulate transcription through direct binding to DNA or transcription factors. | ||||||||||||||||||||||
Subcellular Localization | Cytoplasm. Nucleus. Note=In brains of Alzheimer disease patients, present in a subset of amyloid- containing plaques. | ||||||||||||||||||||||
Disease Associations | |||||||||||||||||||||||
Tissue Specificity | Ubiquitously expressed, with highest levels in testis. Present in kidney, liver and brain. In the brain, highest levels are found in motor cortex (at protein level). {ECO:0000269PubMed:10662542, ECO:0000269PubMed:10727212, ECO:0000269PubMed:7621746, ECO:0000269PubMed:9225734}. | ||||||||||||||||||||||
Comments | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Protein Structure and Domains | |||||||||||||||||||||||
PDB ID | |||||||||||||||||||||||
InterPro |
IPR001487
Bromodomain IPR001965 Zinc finger, PHD-type IPR004022 DDT domain IPR011011 Zinc finger, FYVE/PHD-type IPR013992 Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal IPR018500 DDT domain, subgroup IPR018501 DDT domain superfamily IPR019787 Zinc finger, PHD-finger |
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PFAM |
PF00439
PF02791 PF01213 PF00628 |
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PRINTS |
PR00503
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PIRSF | |||||||||||||||||||||||
SMART |
SM00297
SM00249 SM00571 |
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TIGRFAMs | |||||||||||||||||||||||
Post-translational Modifications | |||||||||||||||||||||||
Modification | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q12830 | ||||||||||||||||||||||
PhosphoSite | PhosphoSite-Q12830 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2186 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.739081 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NP_004450 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3581 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 601819 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||
HPRD | 03490 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB032251 AC006534 AC107377 AC134407 AY282495 BC067234 U05237 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA97522 AAH67234 AAP22284 BAA89208 | ||||||||||||||||||||||